Instytucja o niezwykle bogatej i długiej historii. Jej historia sięga 1811 roku. Wtedy właśnie Stanisław Kostka Zamoyski przeniósł księgozbiory Jana Zamoyskiego, profesorów Akademii Zamojskiej oraz Szymona Szymonowica do Warszawy i tam ustanowił Bibliotekę Ordynacji Zamojskiej, która do czasu II Wojny Światowej działała jako placówka naukowa. Na przestrzeni wielu lat udało się stworzyć Bibliotekę Miejską, która przestała pełnić jedynie funkcję naukową, a zaczęła także spełniać potrzeby społeczne. I tak w 1921 roku powstała Biblioteka Publiczna im. Jana Zamoyskiego w Zamościu. W czasie wojny Niemcy próbowali uszczuplić jej zbiory, przeprowadzając systematyczne kontrole, jednak dzięki przechowaniu materiałów u czytelników udało się uratować wiele cennych tytułów.
Wraz z utworzeniem województwa zamojskiego 1 lipca 1975 roku powołano Wojewódzką i Miejską Bibliotekę Publiczną w Zamościu. Niestety po likwidacji województwa placówka utraciła status wojewódzkiej, a stała się samorządową instytucją kultury prowadzoną przez Urząd Miasta Zamość, z zadaniami biblioteki powiatowej. W 2005 roku placówka przeniosła się do nowej siedziby przy ul. Kamiennej, a trzy lata później zmieniła nazwę na: Książnica Zamojska im. Stanisława Kostki Zamoyskiego w Zamościu.
